با توجه به ویژگی‌های منحصر به‌فرد صنایع دفاعی و با وجود اطلاعات محرمانه و طبقه‌بندی شده، محدودیت در منابع و مقررات و هم‌چنین رقابتی نبودن محصولات این صنعت و متنوع بودن تهدیدات کشور، لازم است بررسی‌های دقیق و کاملی به‌عمل آید تا بتوان هزینه‌ها را کاهش داده و پایداری و ایمن‌سازی را به‌عمل آورد. از این رو، پدافند غیرعامل مهم‌ترین نقش را ایفا می‌نماید. مهم‌ترین چالش‌های پدافند غیرعامل در صنعت دفاعی عبارتند از: مکان یابی مناسب، پراکندگی(آمایش سرزمینی) ایمن‌سازی و پایداری، استمرار تولید در زمان بحران و جنگ. و برخی از راه‌کارهای مقابله با این چالش‌ها عبارتند از: تدوین راهبرد پدافند غیرعامل و اجرای آن در سطح صنایع دفاعی و به‌کارگیری سامانه‌های اطلاعاتی، کوچک‌سازی و بومی‌سازی محصولات فوق.
)